دکتری در بیوانفورماتیک / مدل‌سازی ساختاری (م/ز)

این موقعیت یک برنامه دکتری سه‌ساله در آزمایشگاه بیولوژی و مدل‌سازی سلول (LBMC) از École Normale Supérieure de Lyon است. پژوهش بر ساختن شبکه تعامل پروتئین‑پروتئین بین دستگاه Kil و سیستم T3SS میکسوکاکوس زانتوس با استفاده از ابزارهای پیشرفته پیش‌بینی ساختار مبتنی بر یادگیری عمیق مانند AlphaFold و RosettaFold متمرکز است. داوطلب شبیه‌سازی‌های بزرگ مقیاس بر روی GPU را اجرا، تماس‌های داخل و بین کمپلکس‌ها را تحلیل و نتایج را در یک مدل مکانیکی از شکار باکتری‌ها ادغام خواهد کرد. این کار در تیم DAMM تحت نظارت Riccardo Pellarin و Juliette Martin انجام می‌شود و پایان‌نامه دکتری به دانشگاه ارائه خواهد شد.