دانشجوی دکتری در تحلیل با توان عملیاتی بالا برای برهم‌کنش‌های پروتئینی

این موقعیت دکتری به طور مشترک توسط آزمایشگاه نش در دانشگاه بازل و دپارتمان علوم و مهندسی زیست‌سیستم‌های دانشگاه زوریخ میزبانی می‌شود. نامزد مورد نظر به طراحی و اعتبارسنچی سنجش‌های با توان عملیاتی بالا خواهد پرداخت که نمایش سطحی مخمر و توالی‌یابی عمیق را برای اندازه‌گیری برهم‌کنش‌های پروتئینی وابسته به نیرو مربوط به لخته شدن خون ترکیب می‌کند. این پژوهش، مهندسی پروتئین تجربی را با مدل‌سازی محاسباتی در همکاری نزدیک با یک گروه زیست‌شناسی محاسباتی ادغام می‌کند. مسئولیت‌ها شامل ساخت کتابخانه‌های واریانت DNA، تحلیل مجموعه‌داده‌های توالی‌یابی با توان عملیاتی بالا و آموزش مدل‌های یادگیری ماشین پیش‌بین است. متقاضی موفق در برنامه دکتری D-BSSE ثبت‌نام خواهد کرد، در نظارت بر کارهای عملی کارشناسی مشارکت خواهد نمود و یافته‌ها را برای انتشار آماده می‌کند.